Паметном фонтаном је лакше управљати када је систем управљања подељен у јасне групе. Пумпе, светла, вентили и музички сигнали не би требало да раде са једног једноставног прекидача. У великом пројекту, оператеру ће можда бити потребан тихи дневни режим, светлији режим викенда и музичка емисија за празнике. ПЛЦ орман или екран осетљив на додир могу ускладиштити ове програме и смањити поновљени ручни рад.
Подешавања заштите су такође важна. Сигнали нивоа воде, заштита од цурења, заштита од преоптерећења и заустављање у нужди могу смањити ризик од опреме током свакодневне употребе. За одржавање, свака пумпна група треба да има број, а траса кабла треба да одговара цртежу. Када се деси квар, особље може брзо да пронађе погођену зону уместо да заустави целу фонтану на дуже време. Добар план контроле такође оставља простор за касније промене програма када се на тргу појаве нови догађаји.
